无论是吸烟者或吸二手烟者，肺部的气管、纤毛都会受损，所以病菌进入后无法有效的被排出体外，加上受损的肺部也可能有化脓症状，影响身体免疫力，导致清除外在感染源、细菌病毒的能力变差，更易受到感染。以肺炎链球菌为例，吸烟者比未吸烟者受到侵袭性肺炎链球菌感染的机率大约高出4.1倍，而吸二手烟者也高约2.5倍。
专家分享了一则案例，一名年约65岁、有40年抽烟史男子，因感冒就医，但在第三周回诊时有持续高烧现象，并因发炎导致败血症和出现呼吸困难，经检查，确认患者感染肺炎链球菌肺炎，施以抗生素和氧气治疗长达三周才稳定病情;但患者出院后回诊追蹤肺功能，肺功能指数比从前下降很多，留下易喘的后遗症;专家表示，除了建议患者积极接受戒烟治疗，还会建议施打肺炎链球菌疫苗以避免再次受到侵袭。
因此，别强调「预防胜于治疗」的重要性，尤其是吸烟者，应该从平时做好防护工作：
‧应培养运动习惯，以提升身体免疫力、肺活量以及排痰能力，避免病菌侵袭。
‧出入公共场合应带口罩。
‧戒烟能减少对肺部的持续伤害并减少肺炎链球菌感染的机会。
‧施打肺炎链球菌疫苗，增强免疫保护力。
「任何时间施打疫苗都不嫌晚。」专家进一步补充。50岁以上高危险族群应优先接种一剂肺炎链球菌结合型疫苗。美国疾病管制局疫苗接种谘询委员会也针对65岁以上从未接种过肺炎链球菌疫苗者，建议优先接种肺炎链球菌结合型疫苗;若曾接种过多醣体疫苗者，则建议间隔一年，再接种一剂结合型疫苗，增加长期保护力。
