拜发现特定基因所赐，研究内在生理时钟机制的时律生物学(Chronobiology)近年来已爆炸性成长。这些基因帮助让我们体内的系统与昼夜同步，让我们的身体在黎明与黄昏时产生化学改变。
了解生理时钟有助医生使用正确疗程，包括採取不同治疗的最佳时间，也指引出新的疗程策略，例如调整居家光线以帮助人们睡得更香甜。当然，人们常因搭机旅游、工作时程混乱、看电视和上网到深夜，而打乱生理时钟，这会引发各种健康风险，包括心脏病和糖尿病。
维护生理时钟的机制，是一组丘脑下部的神经元，位置就在眼睛后方，名为视叉上核(SCN)，SCN会使松果体释出褪黑激素这种让人想睡觉的荷尔蒙，体温、血压和心跳等运作速度都在深夜进入最低。
其他系统则在夜间高度活跃。胃酸分泌在晚间10时到凌晨2时进入高峰，以消化晚餐，肝脏在黎明前一刻把葡萄糖释入血液，抑制食欲的纤瘦素则偏高，让人们刚起床时不致太饿。
上午光线进入视网膜后，就代表SCN要关闭褪黑激素，转而提高压力荷尔蒙皮质醇，让身体準备应对一日所需，血压开始升高，心跳也加速。当然，饮食、睡眠和其他行为类型都会影响人体的日常改变，但研究显示，血压、心跳、血栓及肾上腺素都有自己的生理时钟，若行为类型和生理时钟不同步，就会引发各种健康问题，轮班劳工罹患心脏疾病、糖尿病、肥胖、高血压及中风的机率较高，
数百万人已发展出「社会时差」，也就是每周会有好几天熬夜和较晚起床，但研究显示，周间和周末睡眠时间差愈多的人，肥胖可能性愈高，而有抑郁、躁郁症和其他心理健康问题的人，生理时钟多被打乱，睡眠也不规律，躁郁症患者的生理时钟循环常超过24小时。
研究员正开始利用生理时钟、或恢复生理时钟的疗程策略。例如在夜间吃药有助避免心肌梗塞，从而降低清晨心脏病发作的风险，在夜间服用制酸药物的效益也更高，因为胃酸分泌在夜间暴增，光线疗程也有助改善年长者的睡眠品质。
上午
●利尿剂：避免夜间频繁小解
●骨质疏松药物：空腹服用，提高吸收效果
●关节炎药物：在预估复发时间前四小时服用
晚上
●制酸药物：晚餐时间服用，因为胃酸分泌在夜间到达高峰
●每天服用降低心脏疾病风险的阿斯匹灵：降低清晨的凝块形成
