王仁义追上来，发现正是李世民，这时后边的士兵们就要过来了。王仁义催李世民赶快逃走。他又带着士兵朝别处追去。李世民慌不择路，被陷阱抓住，原来是王世充不放心王仁义办事，自己亲自来了。
程咬金击退了官兵赶快来寻找李世民，却找不到，回到岸边找到秦琼才知道主公并没有回来，让秦琼回去搬救兵，自己回去找。打探到消息这才知道李世民已经被王世充抓走了。程咬金想去最近的唐军处去搬兵回来营救主公。路经少林寺却遇见了九斤和高飞扬，这才把情况跟众人说了一下。
王世充想要李世民作人质要挟李渊来尊自己为皇帝，李世民答应。王仁义一心想要找机会报仇，但是心里还是深爱着王玉凤，他劝王玉凤尽早离开洛阳。不想他成为改朝换代的牺牲品。铁虎回报王仁则被抓住了，并且少林寺中还藏了张天保等逃犯，刚好被王玉凤听见，这时他才知道自己一直都被欺骗了。想要去查清楚。王世充派王仁义带兵去少林寺营救王仁则。
少林寺传奇之十三棍僧分集剧情介绍 第42集 王仁则被抓住了，周锦福和佟锐、张天保他们想要乘机去杀了王仁则报仇。但是却被僧丰拦住。昙宗和程咬金等人商量之后决定在不得已的时候用王仁则来交换李世民，如今天下kugou.tv大乱，想要普度众生，保护少林寺就得推翻王世充。昙宗赶来及时阻止了周锦福他们的报仇举动。派人严加看管。昙宗决定带领几位弟子潜入洛阳天牢去营救李世民。派桓法嗣和张天保、九斤、高飞扬等人好好看守王仁则。
王仁义带兵向少林寺进发，王世充派黑豹监视王仁义，一旦出现意外就除掉王仁义。
昙宗正要出发，道广禀报说王仁义带兵包围了少林寺。要少林寺交出王仁则，否则就要剿灭少林寺。张天保主动要去找王仁义，希望能够劝说王仁义放了李世民。
王仁义计划让张天保帮自己把王仁则除掉，这样就除去了王世充的虎牙，就更容易报仇了。张天保不好下手，决定找机会放了王仁则，在山上除掉王仁则。张天保回来告诉大家没有办法。昙宗决定还是带领了弟子前往洛阳营救李世民。
王玉凤看洛阳城已经混乱，劝说王世充，王世充不听。无奈之下王玉凤只想去找到张天保，她带侍女挖开了张天保的坟，却发现并没有尸体，这才确定张天保真的还活着。于是决定到少林寺去找他。王玉凤来到王仁义的军中，质问王仁义，王仁义为了不让王玉凤影响到自己的计划，下令把她软禁起来。这时黑豹过来把他们放走了。王仁义得知公主跑了于是派人去追。
张天保来到悔心洞，和九斤决定要教训教训王仁则，在打斗中张天保乘机把钥匙仍在了地上。王仁则打开铁链逃走了。刚跑下山，到处都是机关陷阱。
少林寺传奇之十三棍僧分集剧情介绍 第43集 原来是张天保暗算王仁则，这时高飞扬、九斤等人也赶来了，眼看他们不能抓住王仁则，他们决定就地除掉王仁则，宁愿除掉他也不能放虎归山。这时王仁义也赶来了，他们一同齐心协力把王仁则打下山崖。
王仁义还要回去找机会除掉王世充，张天保他们回到寺中。王玉凤来到少林寺外，寻找张天保，这时郑军也来到少林寺外，朝着少林寺射箭，银儿为了保护公主被乱箭射死。王玉凤进入少林寺中去找张天保。桓法嗣正为王仁则逃跑的事情犯愁，看到王玉凤竟然自己送上门来了。就抓住了王玉凤作为人质。张天保从后山赶回，看桓法嗣竟然抓王玉凤作为人质，就要和桓法嗣翻脸，救回王玉凤。桓法嗣早料到他会意气用事，要弟子们看守好，不能让他接近。
王仁义回到军中，没有料到王仁则竟然已经回来了，并没有摔死。王仁则明白了王仁义要造反，和王仁义打起来，这时黑豹从后边偷袭王仁义，一棒把他打倒。王仁则并没有杀了王仁义，而是把他吊在山门前，想引诱张天保出来救他，在把他们兄弟一网打尽。张天保得知弟弟天永被王仁则吊在山门外，就要冲出去救人。张天保攻破了藤牌钩刀阵，冲进去营救张天永，高飞扬不忍心看张天保一个人去，也来助他一臂之力。
王仁义也背叛了自己，王世充让铁虎小心看守李世民，派人传召王仁则，赶快灭掉少林寺，班师回朝。
少林寺传奇之十三棍僧大结局 第44集 张天保他们被郑军包围了起来，就要不敌，这时桓法嗣和九斤也赶来了。师兄弟几个现在已经不同以往，功夫大有精进，再加上面对的又是自己的仇人，下手自是不留情。一帮人经过一番苦斗竟然冲出了包围，救出了张天永。
王仁则本要杀进少林寺去，但王玉凤还被少林寺关住了。王仁则派黑豹带人潜进少林寺去设法救了公主，自己再带兵进攻少林寺。
救醒了张天永，得知王玉凤竟然被关在少林寺里，张天永就要去救他。夜晚黑豹带人潜入少林寺中，看守的道广不敌他们，这时张天永杀出，看到这个偷袭了自己的黑豹，张天永心中升起一团怒火。张天保趁乱打开柴房的门，放走了王玉凤。黑豹那是他的对手，张天永打倒了黑豹，冲进柴房就要去营救公主，不料公主已经不见了。这时黑豹临死之前还是发出了讯号。
在后门处张天保送王玉凤走，桓法嗣带人追上来就要拿下公主，方丈赶到，少林寺乃是出家人，不愿为难公主，更不能那她作为人质来自保。王玉凤感动自愿留下来为少林寺解围。方丈不愿坏了少林寺的声誉谢绝了她的好意。王玉凤只好离开。
王仁则带兵朝少林寺发射飞天火石，少林寺已经一片火海，方丈让弟子们赶快从后门逃走，去洛阳寻找昙宗，帮助师父昙宗去。王仁则攻进寺里一番厮杀，把少林寺众僧屠杀殆尽。方丈和僧值也自焚身亡。只有张天保、九斤他们六人逃了出来。
昙宗他们来到洛阳城，闯进天牢中寻找李世民。王世充得到消息，昙宗师徒已经进入天牢，随即派铁虎带兵包围天牢，务必要把昙宗消灭在天牢中。
王玉凤看到少林寺被毁，很心痛。王仁则要带她回去，王玉凤一把抓起一把刀就要自尽。
少林寺传奇之十三棍僧大结局 第45集 看到自己的父亲现在变成了一个暴君，天下大乱，民不聊生。王玉凤不愿回去，带着杏儿走了。路经尼庵，梵音声声。想到自己的父亲残暴不仁，杀害忠良。害得天下百姓妻离子散，流离失所。堂兄更是残忍的焚寺屠僧。自己心爱的人也遁入空门......想起过去的种种，决定遁入空门，出家为尼，为死者超度，希望可以藉此帮助自己的父亲消除一分冤孽，减去一分罪行。
昙宗他们救得李世民就赶快带领徒弟们离开。走进天牢夹道，铁虎已经带领士兵包围了他们，在天牢夹道两头滚动的刀车已经把他们夹在中间。昙宗让僧满保护李世民，带领众弟子用达摩棍击退了这一轮的攻击。接着郑军又结成盾阵，昙宗师徒利用千斤坠压垮了盾阵。但是他们还是陷入了重重包围。
张天保等人已经来到洛阳城外，眼看城中百姓都往城外逃难，得知师父已经攻进天牢中去了，众人不敢怠慢。昙宗师徒打出天牢大门，铁虎带兵正在这里等着，众僧一边保护李世民，一边施展少林棍法抵挡军队的攻击。这时张天保、九斤等人赶到，十三棍僧聚齐，铁虎被九斤一棍顶到了官兵的枪阵上去，当场毙命。
到了城门口正遇到了班师回朝的王仁则，又自是一番好打。众徒弟用师父所教的罗汉奇门棍阵和王仁则打斗，王仁则不敌棍阵。
王世充在身边还训练了十三妖僧来专门对抗昙宗，又发现身边的另一个高手，就是当初在废墟山庄的画匠，画匠曾被王世充救过一命，一直隐藏在他身边希望报恩。得知铁虎已死，李世民被昙宗救出，王世充带兵赶到城门口去营救王仁则，唐军大军已经到了洛阳城下，王世充赶快命人关上城门。王仁则看回城无望，决定垂死挣扎。
少林寺传奇之十三棍僧大结局 第46集 程咬金冲上前去，李世民来不及阻止，程咬金就一斧劈了王仁则。王世充看到侄儿被杀心痛不已。威胁李世民若敢攻城就一把火烧了洛阳城，让全城百姓给自己陪葬。李世民怕王世充真的恼羞成怒，玉石俱焚。不敢贸然进攻正和众将领商议对策，这时昙宗大师请愿，愿进洛阳城劝说王世充放下屠刀。
昙宗师徒来到皇宫，众弟子都和王世充有深仇大恨，但是为了洛阳的数万黎民百姓，都愿意饶恕王世充的罪过。昙宗劝王世充放弃抵抗，只此一件事就足以救得数万苍生，抵去罪孽，并保证王世充的安全。王世充也深知自己败局已定，让昙宗师徒先走，自己要想想才能答复。
昙宗师徒走出大殿，突然从四面八方冲出数千郑军把他们包围起来。十三棍僧施展罗汉奇门棍阵，打退郑军的攻击。这时候画匠出现，画匠、昙宗和王世充乃是当今武林的三大高手。画匠更是熟悉少林功夫，众弟子们都不是他的对手，高手对决，胜负只在毫厘之间。昙宗不愿伤害他的性命，只是把他打伤，画匠落败自杀身亡。接着王世充训练的十三妖僧出现。妖僧练就的是邪门武功，浑身上下犹如铜皮铁骨一样。功夫路数也是学的少林功夫，弟子们都敌他们不过，被纷纷打伤。昙宗发现他们功夫的命门在眼睛上，这样才破了他们的功夫。
王世充眼看手下这些训练的妖僧都被打败了，自己提刀上前全给杀了。王世充武功高强，昙宗和众弟子们都被他打伤了。经过一番艰难的打斗，昙宗用少林绝学打败了王世充。这才带领弟子们走了。
李世民抓住王世充将他押回长安去了。李世民要封昙宗为大将军，随军征讨叛逆。昙宗拒绝了李世民的好意带着弟子们回到少林寺重整寺院，诵经礼佛，振兴少林武学。(少林寺传奇之十三棍僧完)
